La digestione è il primo passaggio della nutrizione degli organismi viventi, il processo chimico e/o meccanico che trasforma e riduce in complessità i principi nutritivi assunti, in genere macromolecole o strutture biologiche complesse, in sostanze più semplici assorbibili ed assimilabili dall’organismo. La digestione è una frammentazione di tessuti biologici e molecole complesse (polimeri o trigliceridi) in molecole più semplici (monomeri), una prima forma che conduce al catabolismo senza la contemporanea liberazione d’energia in eccesso come energia chimica. Comprende sia i processi digestivi propri dell’apparato digerente nei metazoi, sia la digestione all’interno della cellula, ad esempio nei vacuoli digestivi, nell’ambito della fagocitosi, la digestione di molecole complesse come la lignina da parte di funghi come gli ascomiceti, ed in generale tutti i processi di degradazione a fini assimilativi dei viventi. Nonostante il termine sia utilizzato prevalentemente per gli organismi eterotrofi, viene chiamata in genere digestione ogni forma di degradazione a scopo metabolico, compresa quella effettuata dalle piante carnivore per procurarsi elementi minerali essenziali, come l’azoto da fissazione biologica assente nei terreni da loro abitati, dalla digestione dalle molecole complesse di piccoli organismi animali.